Po únorovém převratu v roce 1948 se zapojil do protikomunistického odboje. Mezi činnost  odbojové skupiny patřilo rozšiřování protirežimních letáků a zastrašování podporovatelů režimu.
V březnu 1950 byli zatčeni při pokusu o přepadení služebního auta s penězi, kterými chtěli financovat svou odbojovou činnost.
Přestože byli ozbrojeni, nepoužili své zbraně, přepadení nebylo úspěšné a všichni tři tak byli zatčeni.
V únoru 1951 byl Musil ve veřejném politickém procesu spolu s Jankem a Profousem za trestný čin velezrady a za další trestné činy odsouzen k trestu smrti.